PERFORMA GENOTIP IKAN TAMBAKAN Helostoma temminckii (CUVIER, 1829) POPULASI SUMATERA, JAWA DAN KALIMANTAN DENGAN METODE RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD)

PERFORMA GENOTIP IKAN TAMBAKAN Helostoma temminckii (CUVIER, 1829) POPULASI SUMATERA, JAWA DAN KALIMANTAN DENGAN METODE RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD)

Authors

  • M. H. Fariduddin Ath-thar Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar Bogor
  • Intan Putriana Departemen Budidaya Periaran, Institut Pertanian Bogor
  • Dinar Tri Soelistyowati Departemen Budidaya Periaran, Institut Pertanian Bogor
  • Rudhy Gustiano Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar Bogor

DOI:

https://doi.org/10.31938/jsn.v4i1.77

Abstract

Genotype performance of Tambakan, Helostoma temminckii (Cuvier, 1829) from Sumatera, Java and Kalimantan Polulation using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)

        Tambakan, kissing gourami (Helostoma temminckii) is well known as a freshwater tropical  species from Southeast Asia. In Indonesia, tambakan is an important commodity. However, total production of tambakan tends to decrease. Therefore, domestication has urgently to be done to solve the problem of Tambakan population. Three different tambakan populations from Sumatera, Java and Kalimantan were observed to find good genetic resources for culture activity. This study aimed to investigate the genetic variation of tambakan especially from West Java, Jambi, and South Kalimantan province using RAPD. The result showed that the highest polymorphism and heterozygosity was from South Kalimantan population among others. The three population observed had the fragment size ranged from 100- 2000 bp. The highest genetic distance was between Sumatera and Kalimantan (0,2877), while the lowest was between Kalimantan and Java (0,1961).

Key words: Helostoma temminckii, genetic, heterozigosity, genetic relationship

 

ABSTRAK

        Ikan tambakan (Helostoma temminckii) adalah salah satu jenis ikan air tawar yang berasal dari wilayah tropis, tepatnya Asia Tenggara. Di Indonesia ikan tambakan merupakan salah satu ikan komoditas penting. Saat ini, jumlah produksi ikan tambakan cenderung menurun. Sehingga domestikasi sangat diperlukan untuk mengatasi masalah peneurunan populasi tambakan Tiga populasi ikan tambakan dari Sumatera, Jawa dan Kalimantan diobeservasi untuk mendapatkan sumber genetic terbaik yang dapat digunakan untuk kegiatan budidaya.. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman genetika populasi ikan tambakan Jambi, Jawa Barat dan Kalimantan Selatan menggunakan metode RAPD. Hasil menunjukkan bahwa polimorfisme dan heterosigositas tertinggi terdapat pada populasi ikan tambakan Kalimantan Selatan jika dibandingkan dengan populasi ikan tambakan lainnya. Ukuran fragmen DNA teramplifikasi berkisar antara 100-2000 bp. Jarak genetik paling jauh adalah antara populasi tambakan Sumatera dengan Kalimantan (0,2877), sedangkan jarak genetik terendah adalah tambakan Kalimantan dengan Jawa (0,1961).

Kata kunci: Helostoma temminckii, genetik, heterosigositas, kekerabatan

Downloads

Download data is not yet available.

References

Ali, B.A., Huang T.H, Qin D. N., Wang X.M. 2004. A review of random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in fish research. Reviews in Fish Biology and Fisheries 14: 443-453

Dieffenbach, C.W dan Dveksler G. S. 2003. PCR primer: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 520 pp

Direktorat Jendral Perikanan Tangkap. 2012. Statistik perikanan tangkap Indonesia 2012. Kementerian Kelautan Per-ikanan

Dunham, R.A. 20011. Aquaculture and fisheries biotechnology: Genetic Approach. CABI Publishing, Cambridge, USA. P: 85-99.

FAO. 2010. Helostoma temminckii (Cuvier, 1829). Species fact sheet. FAO, Roma

Falconer, F.S. dan Mackay T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics. Longman England. 464pp

Gjedrem, T. 2005. Selection and breeding programs in aquaculture. Springer. New York. P: 251-277

Gustiano R., Kusmini I.I., Ath-thar M.H.F. Mengenal sumber daya genetik ikan spesifik lokal air tawar indonesia untuk pengembangan budidaya. PT Penerbit IPB Press.

Kapuscinski, A.R dan Jacobson L.D. 2007. Genetic guideline for fisheries management. University of Minnesota, Minnesota Sea Grant Collge Program. Sea Grant Research Report 17, 1-66

Kirpichnikov, V.S. Genetic Bases of Fish Selection. Springer Verlag Berlin. 410pp

Nei, M and Tajima F.. 1981. DNA Polymorphism detectable by resctriction endonuclease. Genetics 97: 146-163.

Nugroho, E., M. Takagi, N. Taniguchi. 1997. Practical manual on detection of DNA polymorphism in fish population study. Bulletin of Marine Sciences and Fisheries 17:109-129.

Rainboth, W.L. 1996. FAO species identification field guide for fishery purposes. Fishes of the Cambodian Mekong. Rome, FAO. 265 pp.

Tave, D. 1993. Genetics for fish hatchery managers. Kluwer Academic Publications. Netherland. 415pp

Downloads

Published

2017-12-01

How to Cite

Ath-thar, M. H. F., Putriana, I., Soelistyowati, D. T., & Gustiano, R. (2017). PERFORMA GENOTIP IKAN TAMBAKAN Helostoma temminckii (CUVIER, 1829) POPULASI SUMATERA, JAWA DAN KALIMANTAN DENGAN METODE RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD). JURNAL SAINS NATURAL, 4(1), 68–75. https://doi.org/10.31938/jsn.v4i1.77

Metrics

Loading...